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基因组大数据阐发

  • 主 编:袁细国
  • 副主编:赵海勇 王绍强 陈念华
  • 书代号:616200
  • I S B N:978-7-5606-5860-5
  • 出书日期:2020-08
  • 印刷日期:2020-08
  • 营业分类:本科;
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  • 纸书价钱:- 元 原价:24.00
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内容简介
媒介
目次
编辑保举
相干资本
    

本书首要先容基因组大数据阐发与处置的相干手艺。书中按部就班地先容了相干生物信息学软件的下载和装置体例,供给了实在数据和仿真数据的获得或天生体例;针对拷贝数变异、单元点变异、布局变异和微生物物种判定等题目,周全先容了相干处置进程及根基道理,并连系典范算法说了然数据处置的根基流程。

本书最大的特点在于供给了丰硕的算法实例,每个实例都是颠末经心遴选的,具备很强的针对性,力图使读者尽能够或许快地把握基因组大数据阐发与处置的全进程。

本书合适作为计较机和大数据类相干专业高年级本科生与研讨生的课本,对处置计较生物学研讨的手艺职员也有很好的参考代价。

跟着21世纪互联网行业的高速成长,人们对糊口品质有了更高的请求,基因测序手艺也是以获得了疾速成长。基因测序手艺作为一种新型基因检测手艺,连系并利用了大数据处置、生物信息学、机械进修、野生智能等多学科常识,今朝已逐步走进人们的糊口,它已在遗传病防备与检测、重生儿产前检测、风行病防控等很多场所大放异彩。基因测序手艺能够或许从血液或唾液中阐发测定基因全序列,展望病人患多种疾病的能够或许性,实时对遗传病等停止精确防备。跟着基因测序手艺的逐步成熟,愈来愈多的适用东西和软件被人们研收回来,这对基因变异检测的效力和精确率的晋升起到了相当主要的感化。

本书第一章从基因测序手艺的角度动身,先容基因组测序手艺的相干观点,全方位展现该范畴国际外最新研讨功效。第二章详细讲授经常利用测序软件,比方序列比对软件(Burrows-Wheeler-Alignment Tool,BWA)、生物信息比对东西(Samtools)、基因组阐发东西包(Genome Analysis ToolKit,GATK)等。第三章到第六章针对最罕见的基因变异范例讲授支流的检测方式,并供给详细的数据处置流程。

本书利用的实例基于Ubuntu16.04版本的开辟情况开辟,是以,读者若想利用本书中提到的方式,须要对Linux操纵体系有必然的领会。另外,书中包罗代码局部触及C/C++、Python、Java等编程说话,须要读者对编程说话有必然根本,进修时可参考C++ Primer入门、Java编程、Python编程等方面的册本。

本书由几位多年处置生物信息大数据处置的教员及学者编写,王双、毛玉芳、郊野、李苗等也到场了局部笔墨清算任务。

在本书编写的进程中作者参阅了局部国际外相干文献,在此对书中所援用材料的作者表现由衷的感激。

因为作者程度无限,书中能够或许还存在一些忽略的地方,恳请读者和专家攻讦斧正。接洽邮箱:[email protected][email protected]

作 者

2020年5月

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